<div><div dir="auto">Dear Brian,</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">It is interesting but I should be removed from the mailing list.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">All the best,</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Mitchell</div><br><div class="gmail_quote"><div>On Tue, 8 May 2018 at 7:14 pm, Brian McMahon <<a href="mailto:bm@iucr.org">bm@iucr.org</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">James<br>
<br>
I'm happy with this report in its current form.<br>
<br>
The "looking forward" comment is very sensible. How about a small<br>
competition with cash prize to write a specific piece of<br>
open-source software (python/perl bindings to CIFAPI,<br>
CIF2-compatible update to Perl STAR::Parser, checkCIF module for<br>
magCIF :-)?<br>
<br>
Brian<br>
<br>
On 08/05/2018 06:06, James Hester wrote:<br>
> Dear COMCIFS,<br>
> <br>
> A draft report for COMCIFS for the 2017 calendar year is appended below <br>
> for your comment and approval. This must be submitted to the IUCr by the <br>
> end of the week.<br>
> <br>
> James.<br>
> <br>
> -- <br>
> COMCIFS report 2017<br>
> ===================<br>
> <br>
> COMCIFS is responsible for maintaining and developing the suite of<br>
> standards known as the Crystallographic Information Framework (CIF) on<br>
> behalf of the IUCr. The committee consists of five voting members and<br>
> a broad collection of advisers and observers. The current voting<br>
> members are James Hester (Chair), Brian McMahon (Secretary), Herbert<br>
> Bernstein, John Westbrook, and John Bollinger. No issues required a<br>
> vote in 2017.<br>
> <br>
> New dictionaries<br>
> <br>
> No new dictionaries were approved in 2017. Preliminary drafts of a<br>
> high pressure dictionary and a topological dictionary were sighted.<br>
> <br>
> Updating legacy dictionaries<br>
> <br>
> COMCIFS is in the process of rewriting all legacy IUCr dictionaries to<br>
> use a modern dictionary definition language (DDLm).  This work is now<br>
> essentially complete for core, powder, twinning and<br>
> constraint/restraint dictionaries. The modulated structure dictionary<br>
> required development of further standards in order to properly<br>
> describe data spread over multiple blocks; a recommendation was<br>
> developed and formally proposed at the end of the year.<br>
> <br>
> The legacy dictionaries are being gradually phased out, with a<br>
> maintainer appointed to ensure that the legacy dictionaries remain<br>
> compatible with the new dictionaries in the overlap period.<br>
> <br>
> Macromolecular standards<br>
> <br>
> The wwPDB is responsible for a large and rapidly expanding collection<br>
> of CIF definitions that encompass concepts and techniques used in the<br>
> macromolecular community. The wwPDB continues to develop powerful<br>
> tools for easy deposition of, and access to, data in mmCIF/PDBx form,<br>
> and continues to encourage an active community of users. In 2017, the<br>
> wwPDB PDBx/mmCIF Working Group has drafted extensions describing<br>
> macromolecular coherent diffraction experiments including definitions<br>
> for describing data collection on potentially vast numbers of crystal<br>
> samples.<br>
> <br>
> Interactions with other standards groups<br>
> <br>
> Collaboration with the NeXus project on harmonising standards took a<br>
> major leap forward during the Hyderabad meeting, with the approval by<br>
> NeXus representatives of a method for wholesale incorporation of CIF<br>
> data into NeXus files. This is initially intended as a way for NeXus<br>
> users to include experimental and sample information defined in<br>
> mmCIF/PDBx dictionaries into raw data files, and is sufficiently<br>
> flexible to allow any data names defined in CIF dictionaries to be<br>
> included in a NeXus file. With the increasing adoption of Dectris<br>
> Eiger Dectectors at macromolecular crystallogrpaphic synchrotron<br>
> beamlines, it has become routine practice to use automatic software<br>
> translation from the Eiger HDF5/Nexus data format to the imgCIF/CBF<br>
> format both on-the-fly and via file systems.<br>
> <br>
> COMCIFS is also closely involved with the new IUCr Committee on Data<br>
> (CommDat). Chairs of both committees attended the committee meetings<br>
> for COMCIFS and inaugural meeting for CommDat held during the<br>
> Hyderabad congress.<br>
> <br>
> JSON<br>
> <br>
> A standard for writing CIF data in the JSON format was approved<br>
> by COMCIFS during 2017. It is expected that this will be useful when<br>
> transferring structural data within web-based applications.<br>
> <br>
> Hyderabad meeting<br>
> <br>
> COMCIFS sponsored a one-day workshop devoted to creating CIF<br>
> dictionaries prior to the IUCr Hyderabad congress, with about 15<br>
> registered attendees.  There was also a well-attended microsymposium<br>
> discussing programming for CIF, NeXus and related file structures<br>
> (MS107). A COMCIFS committee meeting was also held during the congress.<br>
> <br>
> Looking forward<br>
> <br>
> Over the last few years a considerable amount of work has fallen to a<br>
> handful of people. This situation is not sustainable, particularly as<br>
> the first generation of CIF experts move into retirement. The chair<br>
> plans to explore strategies to expand the community of people actively<br>
> engaged with CIF development.<br>
> <br>
> <br>
> <br>
> _______________________________________________<br>
> comcifs mailing list<br>
> <a href="mailto:comcifs@iucr.org" target="_blank">comcifs@iucr.org</a><br>
> <a href="http://mailman.iucr.org/cgi-bin/mailman/listinfo/comcifs" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.iucr.org/cgi-bin/mailman/listinfo/comcifs</a><br>
> <br>
_______________________________________________<br>
comcifs mailing list<br>
<a href="mailto:comcifs@iucr.org" target="_blank">comcifs@iucr.org</a><br>
<a href="http://mailman.iucr.org/cgi-bin/mailman/listinfo/comcifs" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.iucr.org/cgi-bin/mailman/listinfo/comcifs</a><br>
</blockquote></div></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div>Professor Emeritus Mitchell Guss<br>School of Life & Environmental Sciences<br>University of Sydney<br>NSW 2006<br>Australia<br><br>Phone:+61 (0)2 9351 4302<br>Fax:    +61 (0)2 9351 5858</div></div></div>